Abstract The objective of this study was to identify in Angus and Brangus breed animals with extreme temperament, measured as exit velocity, genomic regions and candidate genes associated with bovine temperament. The population was genotyped with the Genomic Profiler HD 150K chip and after the genome-wide association analysis, the SNPs rs133956611 (P=2.65 E-06) and rs81144933 (P=9.58 E-06) were associated with temperament. The mapping analysis of the regions close to the SNP rs81144933 identified the SNCA (alpha-synuclein) and MMRN1 (multimerin-1) genes at 222.8 and 435.9 Kb downstream respectively, while for the rs133956611 loci the gene GPRIN3 (GPRIN family-member-3) was identified at 245.7 Kb upstream, all three genes are located on the BTA6 chromosome. The analysis of SNCA protein-protein interactions allowed the identification of the genes APP (β-amyloid precursor protein), PARK7 (parkinsonism-associated-deglycase), UCHL1 (ubiquitin-C-terminal-hydrolase-L1), PARK2 (parkin-RBR- E3-ubiquitin-protein-ligase), and genes of the SLC family as candidates to be associated with bovine temperament. All these candidate genes and their interacting were resequenced, which allowed the discovery of new SNPs in the SNCA and APP genes. Of these, the SNPs located in introns 5, 8 and 11 of the APP gene affect splicing site motifs. These results indicate that SNCA and its interacting genes are candidates to be related to bovine temperament.

Resumen El objetivo de este estudio fue identificar en animales de raza Angus y Brangus con temperamento extremo, medido como velocidad de salida, regiones genómicas y genes candidatos asociados con el temperamento bovino. La población fue genotipada con el chip Genomic Profiler HD 150K y después del análisis de asociación del genoma completo, los SNP rs133956611 (P= 2.65 E-06) y rs81144933 (P= 9.58 E-06) se asociaron con el temperamento. El análisis de mapeo de las regiones cercanas al SNP rs81144933 identificó los genes SNCA (alfa-sinucleína) y MMRN1 (multimerin-1) a 222.8 y 435.9 Kb corriente abajo, respectivamente, mientras que para los loci rs133956611 se identificó el gen GPRIN3 (familia GPRIN- miembro 3) a 245.7 Kb corriente arriba, los tres genes se encuentran en el cromosoma BTA6. El análisis de las interacciones proteína-proteína de SNCA permitió la identificación de los genes APP (proteína precursora de β-amiloide), PARK7 (deglicasa asociada al parkinsonismo), UCHL1 (ubiquitina C-terminal hidrolasa L1), PARK2 (parkina-RBR-E3-ubiquitina-proteína-ligasa), y genes de la familia SLC como candidatos a estar asociados con el temperamento bovino. Todos estos genes candidatos y su interacción fueron resecuenciados, lo que permitió el descubrimiento de nuevos SNP en los genes SNCA y APP. De estos, los SNP localizados en los intrones 5, 8 y 11 del gen APP afectan a los motivos del sitio de empalme. Estos resultados indican que el SNCA y sus genes interactuantes son candidatos para estar relacionados con el temperamento bovino.

RESUMO: Os objetivos deste estudo foram analisar o pedigree (41.521 registros de 1958 a 2019) da raça Sardo Negro para avaliar a estrutura, evolução e variabilidade genética (VG) da população. Os parâmetros genéticos populacionais utilizados foram: número efetivo de fundadores (fe) e ancestrais (fa); integridade do pedigree; relação genética aditiva (RGA); número de gerações completas (NGC), máximo plotado (NGT) e equivalentes (NGE); tamanho efetivo (Ne); consanguinidade (F); intervalo geracional (IG). O IG médio foi de 7,45 anos. Foram identificados 7.804 fundadores e 4.856 ancestrais, para fe 185 e 97 na fa. As médias e máximas para NGC, NGE e NGT foram 1,6 e 5,0, 2,5 e 6,5, 4,3 e 12, com estimativas de Ne 15,9, 25,9 e 69,0, respectivamente. O aumento de F, vinculado ao Ne, ficou na faixa de 0,72% a 3,1% por geração. A média para F 3,6% e 1,0% em RGA; a proporção de consanguíneos foi de 32,0%, com F na faixa de 0,01 a 62,2% e média de 11,3%. A taxa da população consanguínea foi de 1,3% ao ano. No RGA, a taxa ao ano era de 0,04%. Para a continuidade e projeção da raça, deve-se considerar a evolução de F em função de Ne e as possíveis implicações dos esquemas de seleção. A variabilidade genética sustentada ao longo do tempo resulta do Ne.

ABSTRACT: This study analyzed the Sardo Negro breed pedigree (41,521 animals registered from 1958 to 2019) to determine its structure, evolution, and genetic variability (GV). The population genetic parameters evaluated were effective number of founders (fe) and ancestors (fa), pedigree integrity, additive genetic relationship (AGR); number of complete generations (NCG), maximum generations traced (NMGT), and equivalent complete generations (NECG); effective population size (Ne), inbreeding coefficient (F), and generation interval (GI). The average GI was 7.45 years. A total of 7,804 founders and 4,856 ancestors were identified for a fe of 185 and a fa of 97. The average and maximum values of NCG, NECG, and NMGT were 1.6 and 5.0, 2.5 and 6.5, 4.3 and 12, with Ne estimates of 15.9, 25.9, and 69.0, respectively. The increase in F, linked to Ne, ranged from 0.72% to 3.1% per generation. The average values for F and AGR were 3.6% and 1.0%, respectively. The proportion of inbred individuals was 32.0%, with F values ranging from 0.01 to 62.2% and an average of 11.3%. The rate of inbred population was 1.3% per year. The annual rate of AGR was 0.04%. For the continuity and projection of the breed, the evolution of F as a function of Ne and the possible implications of the selection schemes must be considered. The genetic variability sustained over time results from the Ne.

Abstract In order to define the SNP panel for paternity tests in cattle, genotypes were analyzed in three breeds (number of SNPs evaluated and individuals sampled): Hereford (HER; 202; 1317), Brangus (BRA; 217; 3431) and Limousin (LIM; 151; 8205). Within breed, SNPs with a percentage of genotyped individuals (PGI) less than 90 %, with Hardy-Weinberg disequilibrium (HW; P<0.05), with allele frequency less than 0.10 or less and with linkage disequilibrium, where the correlation between genotypic frequencies was greater than 0.25, were discarded. The levels of expected (He) and observed (Ho) heterozygosity, polymorphic information content (PIC) were estimated; as well as the Shannon index, the fixation index and effective population size (Ne). The combined exclusion probability (CEP) and identity probability (CIP) were calculated. The final panel was 121, 188 and 113 SNPs in HER, BRA and LIM, respectively; the main source of discard was HW followed by PGI. Levels of Ho and He were above 0.40; CIP was greater than 0.32 and Ne presented estimates above 181.3. The results for CEP were higher than 0.999999; for CIP, they were below 1 x 10-20.

Resumen Con el objetivo de definir el panel de polimorfismos de nucleótido simple (SNP) para pruebas de paternidad en bovinos, se analizaron los genotipos en tres razas (número de SNP evaluados e individuos muestreados): Hereford (HER; 202; 1317), Brangus (BRA; 217; 3431) y Limousin (LIM; 151; 8205). Dentro de raza, se descartó los SNP con porcentaje de individuos genotipados (PIG) menor a 90 %, con desequilibrio Hardy Weinberg (HW; P<0.05), con frecuencia de alelo menor de 0.10 o menos y con desequilibrio de ligamiento, donde la correlación entre frecuencias genotípicas fue superior a 0.25. Se estimó los niveles de heterocigosis esperada (He) y observada (Ho), contenido de información polimórfica (CIP); así como, el índice de Shannon, el índice de fijación y tamaño efectivo de población (Ne). Se calculó la probabilidad de exclusión (PEC) y de identidad combinada (PIC). El panel final fue de 121, 188 y 113 SNP en HER, BRA y LIM, respectivamente; la principal fuente de descarte fue HW seguido de PIG. Los niveles de Ho y He fueron superior a 0.40; el PIC fue mayor a 0.32 y Ne presentó estimaciones por arriba de 181.3. Los resultados para la PEC fueron superiores a 0.999999; para la PIC, estuvieron por debajo de 1 x 10-20.

Abstract Pedigree analysis is vital in designing genetic improvement strategies. Population genetic parameters were analyzed in ten sheep breeds in Mexico: Blackbelly (BBL; n= 19,695); Charollais (CHA; n= 5,033); Dorper (DOR; n= 42,171); White Dorper (DOB; n= 4,213); Dorset (DOS; n= 5,557); Hampshire (HAM; n= 12,210); Katahdin (KAT; n= 77,955); Pelibuey (PEL; n= 42,256); Rambouillet (RAM; n= 11,951); and Suffolk (SUF; n= 14,099). All animals were born between 1992 and 2018. The analyses were run with the ENDOG software. Known parents values ranged from 76.4 % (SUF) to 95.3 % (KAT), with an 86.0 % average; animals with unknown parents corresponded to founders. The consanguineous population (as a percentage of total population) fluctuated from 12.3 % in DOS to 48.7 % in DOB, with a 29.7 % average. Average inbreeding (F) ranged from 3.9% (KAT) to 14.6% (DOB), with an 8.0 % average. The proportion of consanguineous individuals in all populations increased (P<0.05). Genetic relatedness was stable, and F had negative trends (P<0.05). The highest consanguineous population growth rates were present in the KAT, DOB and BBL populations. Inbreeding (F) was highest in DOB and DOS, while genetic relatedness was highest in DOB and CHA. Effective population size (Ne) was greater than 50 in six of the populations but less than 37 in the remaining four. These low Ne values highlight the need to monitor the evolution of F and its possible implications. The generational interval (GI) ranged from 3.0 to 4.15, with a 3.45 years’ average. The highest GI values were for RAM and SUF, and the lowest for BBL and DOR.

Resumen Se analizó el pedigrí en diez razas de ovinos mediante parámetros genéticos poblacionales. Las poblaciones fueron Blackbelly (BBL; 19,695), Charollais (CHA; 5,033), Dorper (DOR; 42,171), Dorper Blanco (DOB; 4,213), Dorset (DOS; 5,557), Hampshire (HAM; 12,210), Katahdin (KAT; 77,955), Pelibuey (PEL; 42,256), Rambouillet (RAM; 11,951) y Suffolk (SUF; 14,099); nacidos de 1992 a 2018. Los análisis se realizaron con el software Endog. En padres conocidos, los valores oscilaron de 76.4 % (SUF) a 95.3 % (KAT), con promedio general de 86.0%, los animales con padres desconocidos correspondieron a los fundadores. La población consanguínea (como porcentaje de la población total) fluctuó del 12.3 % en DOS al 48.7 % en DOB, con promedio general de 29.7 %; la consanguinidad (F) promedio osciló de 3.9 (KAT) a 14.6 (DOB), con promedio general de 8.0. La evolución de F y sus componentes fue: en todas las poblaciones, la proporción de consanguíneos se incrementó (P<0.05); los niveles de relación genética (RG) son estables; y, la F presentó tendencias negativas (P<0.05). KAT, DOB y BBL con altas tasas de crecimiento en población consanguínea; DOB y DOS, DOB y CHA con los niveles más altos de F y RG, respectivamente. Seis poblaciones presentaron tamaño efectivo (Ne) mayor a 50; el resto presentaron Ne menor a 37, lo cual señala el estatus de cuidado para monitorear la evolución de F y sus posibles implicaciones. El intervalo generacional (IG) osciló de 3.0 a 4.15, con promedio general de 3.45 años, los mayores IG fueron para RAM y SUF, BBL y DOR con IG menores.

Abstract We investigated whether a panel of molecular markers previously associated with temperament has an effect on live growth traits. Phenotypic data from 412 Charolais cows categorized according to their age in adult and young cows were used to determine Pearson's correlations between birth (BW), weaning (WW), and yearling live (YW) weight and temperament traits (measured as exit velocity [EV] and temperament score [TS]). For association analysis, selective genotyping of a group of 80 cows identified as the most docile and temperamental were genotyped with a 151-SNP (single-nucleotide polymorphisms) panel of molecular markers previously associated with temperament. Significant Pearson's correlations between birth weight and weaning weight and the two temperament measurements (EV and TS) were observed only in the young cow group. Significant effects of ten SNP on BW and WW were observed. Four markers located on candidate genes for temperament traits also had an effect on birth weight and weaning weight in Charolais cows, which indicates that both traits could be influenced by the same genes.

ABSTRACT The effect of three localized genetic markers in growth hormone (GH), Insulin-like growth factor 1 (IGF-1) and leptin (LEP) genes on feed efficiency indicators was evaluated using records from 136 young bulls of the Charolais, Angus and Brangus breeds during a productive behavior test. The analysis of association between the genotypes obtained and the productive traits evaluated showed a significant effect of the GH-Alu marker on CRA (p = 0.032) in the Angus breed, and in the Charolais one; this result shows that its inclusion in the initial efforts for the determination of efficiency phenotypes in Mexico and its consequent application in selection and breeding strategies are possible.

RESUMEN Se evaluó el efecto de tres marcadores genéticos localizados en los genes de hormona de crecimiento (GH), factor de crecimiento semejante a insulina-1 (IGF-1) y leptina (LEP) sobre indicadores de eficiencia alimenticia, utilizando registros de 136 toretes de las razas Charolais, Angus y Brangus durante una prueba de comportamiento productivo. El análisis de asociación entre los genotipos obtenidos y los rasgos productivos evaluados mostró un efecto significativo del marcador GH-Alu sobre CRA (p = 0.032) en la raza Angus, y sobre el peso final ajustado (p = 0.041), en la Charolais; este resultado muestra que es posible su inclusión en los esfuerzos iniciales para la determinación de fenotipos de eficiencia en México y su consecuente aplicación en las estrategias de selección y mejoramiento genético.

Abstract Characterizing growth in livestock is important when making management, marketing and genetic improvement decisions. Nonlinear models were tested to identify those with the best fit for growth curves in seven sheep breeds [Blackbelly (n= 19,084); Pelibuey (n= 39,025); Dorper (n= 35,814); Katahdin (n= 74,154); Suffolk (n= 10,267); Hampshire (n= 7,561); and Rambouillet (n= 7,384)]. Using breed registry databases, live weight was assessed from birth to 230 d of age. The SAS program was applied to test six nonlinear models: Brody, Verhulst, von Bertalanffy, Gompertz, Mitscherlich and logistic. The criteria for selecting the best-fit model were the average prediction error; the prediction error variance; the Durbin-Watson statistic; the coefficient of determination; the root-mean-square error; and the Akaike and Bayesian information criteria. For the Hampshire, Pelibuey and Suffolk breeds the best-fit model was the von Bertalanffy, with a sigmoid curve and an inflection point age between 40 and 57 d. For the Katahdin, Blackbelly, Dorper and Rambouillet breeds the best-fit models were the Brody and Mitscherlich models, with a continuous growth curve, no inflection point and constant growth rate. Marked differences were observed in adult weight between breeds, with average values (kg) of 44.6 for Blackbelly, 49.2 for Rambouillet, 52.9 for Pelibuey, 55.6 for Hampshire, 60.2 for Katahdin, 64.7 for Suffolk and 65.2 for Dorper; values tended to be highest in the Brody and Mitscherlich models, and lowest in the logistic and Verhulst models.

Resumen Caracterizar el crecimiento ayuda en la toma de decisiones de manejo, comercialización y mejoramiento genético. El objetivo fue identificar un modelo no lineal (MNL) para describir la curva de crecimiento en borregas de registro a través de siete razas. Se evaluó el peso vivo, desde el nacimiento hasta los 230 d de edad, de las razas Blackbelly (BB; n= 19,084), Pelibuey (PE; n= 39,025), Dorper (DR; n= 35,814), Katahdin (KT; n= 74,154), Suffolk (SF; n= 10,267), Hampshire (HS; n= 7561) y Rambouillet (RB; n= 7,384). Se evaluaron los MNL: Brody (BRO), Verhulst (VER), Von Bertalanffy (VBE), Gompertz (GOM), Mitscherlich (MIT) y Logístico (LOG). Los análisis se realizaron con el software SAS. Los criterios para seleccionar el modelo con mejor ajuste fueron: error de predicción promedio, varianza del error de predicción, estadístico Durbin-Watson, coeficiente de determinación, raíz del cuadrado medio del error, criterios de información Akaike y Bayesiano. Para HS, PE y SF, el mejor modelo fue VBE, con una curva sigmoide y edad al punto de inflexión entre 40 y 57 d. Los modelos BRO y MIT tuvieron el mejor ajuste para KT, BB, DR y RB, con una curva continua, sin punto de inflexión y tasa de crecimiento constante. Para peso adulto se observaron marcadas diferencias, con valores promedio (kg) de 44.6 en BB, 49.2 en RB, 52.9 en PE, 55.6 en HS, 60.2 en KT, 64.7 en SF y 65.2 en DR; con la tendencia de valores mayores para los modelos BRO y MIT, y los menores para LOG y VER.

Abstract: The objectives were to characterize the growth of Siboney cows with nonlinear models (MNL) and the effects of growth parameters on age at first mating (AFM). It was analyzed 10 064 live weight data from 2 021 heifers. The MNL evaluated were Logistic, Gompertz, Brody and Bertalanffy. The selection of best model was with the coefficient of determination, Akaike and Bayesian criteria. With a linear regression of quadratic order, the AFM was analyzed with respect to the weight at 24 months (W24M), growth rate (GRA), weight at the point of inflection (WPI) and maturity at 24 months (M24M). The MNL of best fit was Bertalanffy; with asymptotic weight of 514.3 kg, inflection point was at 5.93 months with 152.4 kg. From the regression analysis: AFM = (0.026102)(W24M) - (0.0000636)(W24M2), AFM = (23.86)(GRA) - (59.17)(GRA2), AFM = (0.0796)(M24M) - (0.000675)(M24M2), AFM = (0.0299)(WPI) - (0.00009506)(WPI2), all different from zero (p < 0.01).

Resumen: El objetivo fue caracterizar el crecimiento de vacas Siboney con modelos no lineales (MNL) y los efectos de los parámetros de crecimiento sobre la edad al primer empadre (EPE). Se analizaron 10 064 datos de peso vivo de 2 021 vaquillas. Los MNL evaluados fueron logístico, Gompertz, Brody y Bertalanffy. La selección del mejor modelo fue con el coeficiente de determinación, criterios Akaike y Bayesiano. Con regresión lineal de orden cuadrático, la EPE se analizó con respecto al peso a 24 meses (P24M), tasa de crecimiento (TAC), peso al punto de inflexión (PPI) y madurez a los 24 meses (GM24). El MNL de mejor ajuste fue Bertalanffy; con peso asintótico de 514.3 kg, punto de inflexión a los 5.93 meses con 152.4 kg. Del análisis de regresión: EPE = (0.026102)(P24M) - (0.0000636)(P24M2), EPE = (23.86)(TAC) - (59.17)(TAC2), EPE = (0.0796)(GM24) - (0.000675)(GM242), EPE = (0.0299)(PPI) - (0.00009506)(PPI2), todos diferente de cero (p < 0.01).

Abstract: In Lidia cattle breed, the selection is based on the performance of the bull during the fighting. Head position (HP) and hands (PH), course of the bull (CB) and finish of the onslaught (FO), define the performance of the bull, and can be implemented as selection criteria. The objective was to estimate heritability (h2) and genetic correlation (rg) for HP, PH, CB and FO; and building two selection indexes: IS1 with relative values of factorial analysis, IS2 by relative values from the standard deviation of each trait. The response to selection (RS) and accuracy (AC) were calculated. The number of observations (average ± standard deviation) value for HP, PH, CB and FO were 984 (5.46 ± 1.4), 978 (2.93 ± 1.1), 981 (3.15 ± 0.7) and 785 (2.88 ± 1.1), respectively; with scales of one to seven for HP, and one to five for the rest of the variables. For h2 and rg a multivariate analysis was performed with MTDFREML software. The h2 was of 0.20 ± 0.06, 0.15 ± 0.05, 0.13 ± 0.03 y 0.17 ± 0.05 for HP, CB, PH y FO, respectively. All rg were positive, from 0.57 to 0.94, with average value of 0.753. IS1 = 0.068*HP + 0.048*CB - 0.012*PH + 0.088*FO; with AC of 0.46 and RS of 0.325. IS2 = 0.231*HP + 0.249*CB - 0.038*PH + 0.298*FO; with AC of 0.45 and RS of 1.15.

Resumen: En la ganadería de lidia, la selección está en función del desempeño del toro durante la lidia. Posición de la cabeza (PC) y de las manos (PM), recorrido del toro (RE) y modo de finalizar (FI) la embestida define el desempeño del toro, y pueden ser considerados como criterios de selección. El objetivo fue estimar heredabilidades (h2) y correlaciones genéticas (rg) para PC, PM, FI y RE; y construir dos índices de selección: IS1 con valores relativos de un análisis factorial, IS2 con valores relativos a partir de la desviación estándar de cada rasgo. Se calculó la respuesta a la selección (RS) y exactitud (EX) de cada IS. El número de observaciones (valor promedio ± desviación estándar) para PC, PM, RE y FI fue 984 (5.46 ± 1.4), 978 (2.93 ± 1.1), 981 (3.15 ± 0.7) y 785 (2.88 ± 1.1), respectivamente; con escalas de uno a siete para PC, y de uno a cinco para el resto de las variables. Para h2 y rg se realizó un análisis multivariado con el software MTDFREML. La h2 fue de 0.20 ± 0.06, 0.15 ± 0.05, 0.13 ± 0.03 y 0.17 ± 0.05 para PC, RE, PM y FI, respectivamente; todas las rg fueron positivas, de 0.57 a 0.94, con valor promedio de 0.753. IS1 = 0.068*PC + 0.048*RE - 0.012*PM + 0.088*FI; con EX de 0.46 y RS de 0.325. IS2 = 0.231*PC + 0.249*RE - 0.038*PM + 0.298*FI; con EX de 0.45 y RS de 1.15.

Abstract: The aim of this study was to estimate genetic parameters for mature weight (MW) and growth rate (GR) derived from the nonlinear Brody model, and analyze the possible genetic relationships between these variables and weaning weight (WW). The information analyzed was MW (kg; n = 994), GR (kg kg-1 month-1, n = 994), and WW adjusted to 240 d (kg; n = 1506); the mean values and standard deviation (±) for MW, GR and WW were 419.1 ± 94.4, 0.0081 ± 0.0039 and 206.8 ± 34.1, respectively; the pedigree was composed of 2504 records. A multivariate analysis was performed (MW, GR and WW) from a mixed model that included as fixed effects the contemporary groups and the covariate age of the cow at calving (linear and quadratic), and as random ones the direct and maternal, maternal permanent environment, and residual genetic effects. Direct and maternal heritability, as well as the genetic correlations between direct (r aa ), maternal (r mm ), and direct with maternal effects (r am ) were estimated. The varied from 0.18 to 0.30, and the from 0.07 to 0.39, indicating that there could be a response to the selection in MW and GR. All genetic correlations were positive in an interval of 0.09 to 0.87, except the r aa between MG and GR (-0.57), this genetic antagonism indicates that individuals with high growth rates do not have the highest mature weight.

Resumen: El objetivo del presente estudio fue estimar parámetros genéticos para el peso adulto (PEA) y tasa de crecimiento (TAC) de bovinos Tropicarne, derivados del modelo no lineal de Brody; así como analizar las posibles relaciones genéticas de estas variables con el peso al destete (PD). Se analizaron 994 datos de PEA (kg) y de TAC (kg-1 mes-1) y 1 506 datos de PD ajustado a 240 d. Los valores promedio y la desviación estándar (±) para PEA, TAC y PD (kg) fueron de 419.1 ± 94.4, 0.0081 ± 0.0039 y 206.8 ± 34.1, respectivamente. El pedigrí se integró por 2 504 individuos. Se realizó un análisis multivariado, a partir de un modelo mixto que consideró como efectos fijos los grupos contemporáneos y la covariable edad de la vaca al parto (lineal y cuadrático); y como aleatorios los efectos genéticos directos y maternos, maternos de ambiente permanente y residuales. Se estimó la heredabilidad directa y materna , las correlaciones genéticas entre los efectos directos (raa), los maternos (rmm), y los directos con maternos (ram). Las oscilaron de 0.18 a 0.30, y las de 0.07 a 0.39; lo cual indica una probable respuesta a la selección en PEA y TAC. Todas las correlaciones genéticas fueron positivas en un intervalo de 0.09 a 0.87, con excepción de r aa entre PEA y TAC (-0.57); este antagonismo genético indica que los individuos con tasas altas de crecimiento no son los de mayor peso adulto.

ABSTRACT Nonlinear models (NLM) have been used to evaluate dairy cattle lactation curves (LC), and nonlinear mixed models are increasingly applied. The most appropriate model for estimating LC components in Siboney cattle was identified by applying a NLM for LC to 240 d; comparing a non-mixed NML vs a mixed NML; and estimating peak production (PMAX), total production at 240 d (PTOTAL) and days to maximum production (DPMAX). The database consisted of 15,324 records for daily milk production (kg) corresponding to first lactation in 2,809 Siboney cows (calving date in 2000-2012) in 28 herds in Cuba. Five NLM were evaluated: Wood, Wiltmink, Cobby, Brody and Sikka. Two SAS NLMIXED analyses were run: ANA1, including only the random effect of residuals; and ANA2, including a regression coefficient random effect plus residuals. Selection of the best fitting model was done based on average prediction error; prediction error variance; the Durbin Watson statistic; the determination coefficient (R2); the Akaike information criterion (AIC); and the Bayesian information criterion (BIC). The mixed NLM (ANA2) had the best fit: a) its R2 was higher (9 to 12 %); b) residual variance was notably reduced; and c) the AIC and BIC criteria exhibited a better fit. The model with the overall best fit was the ANA2 WOD, with estimates of 7.71 kg for PMAX, 40 d for DPMAX and 1,653 kg for PTOTAL.

RESUMEN En bovinos productores de leche la curva de lactancia (CL) se ha analizado con modelos no lineales (MNL), y recientemente se ha implementado la metodología de MNL mixtos. Los objetivos fueron: a) ajustar un MNL a la CL a 240 días; b) comparar MNL vs MNL mixtos; c) estimar producción al pico (PMAX) y total a 240 días (PTOTAL), así como días para alcanzar la producción máxima (DPMAX). Se analizaron 15,324 observaciones de producción diaria (kg), correspondientes a primera lactancia de 2,809 vacas Siboney, con fecha de parto de 2000 a 2012 en 28 hatos en Cuba. Se evaluaron cinco MNL: Wood, Wiltmink, Cobby, Brody y Sikka. Se realizaron dos análisis con el procedimiento NLMIXED de SAS: ANA1, incluyó sólo el efecto aleatorio de los residuales; y ANA2, incluyó el efecto aleatorio correspondiente a un coeficiente de regresión, más los residuales. La selección del modelo con mejor ajuste se realizó con: error de predicción promedio; varianza del error de predicción; estadístico Durbin Watson; coeficiente de determinación (R2); criterios de información Akaike (AIC) y Bayesiano (BIC). Los MNL mixtos mostraron el mejor ajuste con base en: a) los R2 del ANA2 fueron superiores, en un intervalo de 9 a 12 %; b) por la reducción en la varianza residual en el ANA2; y, c) los criterios AIC y BIC, mostraron mejor ajuste en los MNL del ANA2. El modelo de mejor ajuste en todo el estudio fue WOD del ANA2, con estimaciones para PMAX, DPMAX y PTOTAL de 7.71 kg, 40 días y 1,653 kg, respectivamente.

The aims of this study were to estimate variance components; calculate heritability (h²) and genetic correlations (r g) predict breeding values (VG) and evaluate their trends over time. Behavior information was analyzed for four Mexican bullfighting ranches: Los Encinos (ENC), Montecristo (MCR), San José (SJO) y Fernando de la Mora (FMO). The analyzed information included was horse tienta (TC), foot tienta (TP), horse bullfight (LC) and foot bullfight (LP). The number of observations ranged from 154 to 2,369, the number of animals in the pedigrees varied from 3,246 to 8,962. Multivariate analyses were conducted using the MTDFREML software. The estimates of h² were from medium to high magnitude, in a range from 0.09±0.05 to 0.47±0.22, and an average of 0.28±0.09. The average of h² by trait was 0.33±0.06 for TC and TP, 0.23±0.14 for LC and 0.27±0.12 for LP. All r g were positive and higher than 0.50, with the exception of TP and LP (0.44±0.38) in FMO, and TC and LP (0.28±0.14) in MCR. The average of the r g within ranches was 0.71±0.14 in MCR, 0.77±0.35 in FMO, 0.78±0.18 in ENC, and 0.85±0.31 in SJO. The trends of the VG were positive and nonzero (P<0.02), with the exception of LP in FMO (P>0.05). The magnitude of the genetic gain per year, as a percentage of the mean, ranged from 0.19 % in LC of FMO to 1.5 % in TP of ENC. The variability of VG suggests its use in breeding programs to promote greater genetic progress.

Los objetivos del presente estudio fueron: estimar componentes de varianza; calcular heredabilidades (h²) y correlaciones genéticas (r g); predecir valores genéticos (VG), y analizar las tendencias a través del tiempo. Se analizó la información de comportamiento en cuatro ganaderías de lidia mexicanas: Los Encinos (ENC), Montecristo (MCR), San José (SJO) y Fernando de la Mora (FMO). La información analizada correspondió a las notas de tienta al caballo (TC), tienta a pie (TP), lidia a caballo (LC) y lidia a pie (LP). El número de observaciones osciló de 154 a 2,369 y el número de animales en los pedigríes varió de 3,246 a 8,962; se realizó un análisis multivariado con el software MTDFREML. Las heredabilidades obtenidas fueron de 0.09±0.05 a 0.47±0.22, y un promedio de 0.28±0.09; la h² promedio por características fue de 0.33±0.06 para TC y TP, 0.23±0.14 para LC y 0.27±0.12 para LP. Todas las r g fueron positivas y superiores a 0.50; con excepción en TP y LP (0.44±0.38) en FMO y TC y LP (0.28±0.14) en MCR. La r g promedio dentro de ganadería fue de 0.71±0.14 en MCR, 0.77±0.35 en FMO, 0.78±0.18 en ENC y 0.85±0.31 en SJO. Las tendencias de los VG fueron positivas y diferentes de cero (P<0.02), excepto en LP de FMO (P>0.05). La ganancia por año, como parte porcentual de la media, osciló de 0.19 % en LC de FMO a 1.5 % en TP de ENC. Las estimaciones de heredabilidad y la variabilidad de los valores genéticos sugieren su utilidad en programas de selección, favoreciendo un mayor progreso genético.

In order to genetically evaluate Angus cattle imported into Mexico as embryos, in comparison with an international reference population and cattle conceived locally, 143 Angus and Red Angus animals were genotyped with the IlluminaBovineSNP50BeadChip® platform, and their genomic breeding values (MVP) were predicted. On average, they were superior to the mean of the reference population regarding traits like direct and maternal calving ease, milking ability, growth from weaning to yearling, carcass weight, muscle development, marbling and the feed lot economic index. The animals bred from imported germplasm were superior to those conceived locally regarding the traits of growth from weaning to yearling, muscle development, marbling, meat tenderness and the economic index. The Angus population that was evaluated proved to have genetic potential from which it is possible to select and use improved breeders.

Con el objeto de evaluar genéticamente bovinos Angus importados a México como embriones, en comparación con una población de referencia internacional y bovinos concebidos localmente, se genotipificaron 143 animales Angus y Angus Rojo con la plataforma BeadChiplllumina BovineSNP50® y se predijeron sus valores de cría genómicos (MVP). En promedio fueron superiores a la media de la población de referencia para características de facilidad de parto directa y materna, habilidad lechera, crecimiento desde el destete hasta el año de edad, peso de la canal, desarrollo muscular, marmoleo y el índice económico de engorda en confinamiento. Los animales originados con germoplasma importado fueron superiores a los concebidos localmente para las características de crecimiento desde el destete hasta el año de edad, desarrollo muscular, marmoleo, terneza de la carne y el índice económico. La población de bovinos Angus evaluada mostró tener potencial genético para seleccionar y utilizar reproductores mejorados.

Pedigree analysis is an important tool to describe the genetic variability and its evolution through generations. The objective was to estimate genetic distances and to analyze the possible genetic differentiation through Mexican fighting bull herds. The pedigree including 58826 animals from 110 herds, born from 1970 to 2010 was used. The average number of animals in a herd was 534, the range was 107 to 4552. With the Software ENDOG it was calculated the Nei genetic distances (DGNei) and the F IS and F ST statistics. Then with the DGNei and using the Software TreeView it was built a graphic representation. The F ST values ranged from 0.0001 to 0.0909, it averaged 0.0086. This value revealed that 0.86% of the genetic variance could be attributed to differences between populations, the 99.14% remaining to differences between individuals within populations. The F IS values ranged from -0.3333 to 0.0099, with average of -0.0167; these results revealed an average increase in heterozygosis of 1.67% and maximum increase of 33.3%, causing a possible disequilibrium Hardy-Weinberg. The DGNei ranged from 0.0009 to 0.0859, with an average of 0.0217; the graphical representation, the arrangement of herds showed no differentiation in groups.

El análisis del pedigrí es una herramienta importante para describir la variabilidad genética y su evolución a través de las generaciones. Con el objetivo de estimar distancias genéticas y analizar la posible variabilidad genética a través de ganaderías de lidia mexicanas, se editó el pedigrí con 58826 individuos de 110 ganaderías, nacidos de 1970 a 2010. El promedio de individuos por ganadería fue 534, con rango de 107 a 4552 individuos. Con el programa ENDOG se estimaron las distancias genéticas de Nei (DGNei), así como los estadísticos F IS y F ST; posteriormente, con las DGNei y el programa TreeView se construyó una representación gráfica. Las estimaciones de F ST fluctuaron de 0.0001 a 0.0909, el promedio fue 0.0086. El valor promedio de F ST reveló que 0.86% de la varianza genética se puede atribuir a diferencias entre poblaciones y el 99.14% restante a diferencias entre individuos dentro de poblaciones. Las estimaciones de F IS oscilaron entre -0.3333 y 0.0099, con un promedio general de -0.0167; estos resultados revelaron un incremento promedio de heterocigosis de 1.67% y máximos de 33.3%, repercutiendo en un posible desequilibrio Hardy-Weinberg. Las DGNei fluctuaron de 0.0009 a 0.0859, con una estimación promedio de 0.0217; en la representación gráfica, el acomodo de las ganaderías no presentó una diferenciación en grupos.

Comportamiento reproductivo de vacas criollas con amamantamiento restringido y sincronización del estro. Los objetivos fueron conocer el comportamiento reproductivo posparto de vacas criollas de rodeo con amamantamiento restringido, la respuesta a la sincronización del estro con protocolos hormonales, los niveles séricos de progesterona y estradiol, la actividad ovárica y la tasa de concepción, con el empleo de inseminación artificial a tiempo fijo. En el Municipio de Soto Maynes, Chihuahua, México durante el verano de 2008, se observó el comportamiento de 27 vacas amamantando durante 95 días y se determinó el inicio de su actividad ovárica posparto por detección de estros, ultrasonografía y niveles séricos de progesterona. En el primer tratamiento, once vacas recibieron un dispositivo intravaginal con 1,9 g de progesterona, inyección intramuscular con 1 mg de β-estradiol + 50 mg de P4. Se retiró el dispositivo intravaginal el día siete más inyección intramuscular de 30 mg de prostaglandina. A las 24 h se aplicó 1 mg de β- estradiol y la IA TF se realizó a las 54 h posteriores al retiro del dispositivo intravaginal. El segundo tratamiento con once vacas fue similar, pero la inyección intramuscular al recibir el dispositivo intravaginal sólo contenía β-estradiol. Se observó un comportamiento agresivo durante el amamantamiento restringido. El reinicio de actividad ovárica, fue a los 11,66 días de haber expuesto a vacas criollas a amamantamiento restringido, 11,11% mostraron estro durante este periodo, todas presentaron estro después de los protocolos hormonales. Hubo interacción T*DS (P=0,06) para niveles séricos de progesterona y estradiol. La tasa de concepción fue de 18,8%. Adicionar progesterona con un dispositivo intravaginal no incrementaron los niveles séricos de progesterona.

Reproductive performance of Creole cows with restricted suckling and estrus synchronization. The objectives were to study the reproductive performance, initiation of post-partum ovarian activity, response to restricted suckling, estrus synchronization, and conception rate using artificial insemination at a fixed time of Creole rodeo cows (C). In Chihuahua, México, during the summer 2008, twenty-seven cows were used over 95 d, and the beginning of post-partum ovarian activity was detected by ultrasonography. Hormone treatment for estrus synchronization was administered to 22 cows (n=11 per group). In treatment1 (T1) the cows (n=11) received a CIDR with 1,9 g of progesterone and one IM injection with 1 mg of β-estradiol + 50 mg of P4. The CIDR was removed after d 7 and an IM injection of 30 mg of PGF2α was applie d. After 24 h, 1 mg of β-estradiol was applied, and the cows were inseminated 54 h after removing the CIDR. T2 (n=11) was similar, but the IM injection contained β-estradiol only. The C showed aggressive behavior (AB) during the restricted suckling. The average days from the beginning of the ovarian activity were 11,66 d and only 11,11% of the cows exhibited estrus during initial ovarian activity. One hundred percent of the animals underwent estrus on d 9 post synchronization, there were not differences (P>0,05) among the levels of progesterone of the T1 (4,94±0,331 ng/ml) vs the T2 (4,87±0,30 ng/ml. There was a T*DS interaction for concentrations of progesterone and E2 (P=0.06). There were no differences (P>0.05) in conception rate (18,8%). Adding P4 with a CIDR did not increase the levels of progesterone in C.